Das von Microsoft entwickelte Dateisystem spart bei großen Festplatten (>512 MB) Platz durch kleinere Cluster.
Bei einer 1.2 GB Festplatte ist mit FAT16 die Clustergrösse 32 KByte, unter FAT32 nur noch 4 KByte.
FAT32 ist neuer und auf Windows 95b- und Windows 98-Systemen zu finden. Leider ist es nicht kompatibel zum Vorgänger FAT16.